Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptrhd1D3Z4S3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptrhd1D3Z4S3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ptrhd1D3Z4S3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptrhd1D3Z4S3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptrhd1D3Z4S3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptrhd1D3Z4S3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptrhd1D3Z4S3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms