Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Cttnbp2B9EJA2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
Cttnbp2B9EJA2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
Cttnbp2B9EJA2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Cttnbp2B9EJA2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Cttnbp2B9EJA2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
Cttnbp2B9EJA2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Cttnbp2B9EJA2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Cttnbp2B9EJA2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Cttnbp2B9EJA2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Cttnbp2B9EJA2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Cttnbp2B9EJA2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.83
Cttnbp2B9EJA2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Cttnbp2B9EJA2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Cttnbp2B9EJA2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Cttnbp2B9EJA2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Cttnbp2B9EJA2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
Cttnbp2B9EJA2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Cttnbp2B9EJA2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Cttnbp2B9EJA2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Cttnbp2B9EJA2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Cttnbp2B9EJA2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Cttnbp2B9EJA2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Cttnbp2B9EJA2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.8
Cttnbp2B9EJA2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Cttnbp2B9EJA2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Cttnbp2B9EJA2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Cttnbp2B9EJA2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Cttnbp2B9EJA2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Cttnbp2B9EJA2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Cttnbp2B9EJA2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Cttnbp2B9EJA2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Cttnbp2B9EJA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
Cttnbp2B9EJA2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Cttnbp2B9EJA2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Cttnbp2B9EJA2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Cttnbp2B9EJA2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Cttnbp2B9EJA2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Cttnbp2B9EJA2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Cttnbp2B9EJA2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Cttnbp2B9EJA2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Cttnbp2B9EJA2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Cttnbp2B9EJA2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Cttnbp2B9EJA2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Cttnbp2B9EJA2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Cttnbp2B9EJA2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Cttnbp2B9EJA2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Cttnbp2B9EJA2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Cttnbp2B9EJA2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Cttnbp2B9EJA2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Cttnbp2B9EJA2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Cttnbp2B9EJA2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Cttnbp2B9EJA2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Cttnbp2B9EJA2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Cttnbp2B9EJA2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Cttnbp2B9EJA2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
Cttnbp2B9EJA2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Cttnbp2B9EJA2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms