Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnldc1B2RXZ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnldc1B2RXZ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnldc1B2RXZ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnldc1B2RXZ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnldc1B2RXZ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnldc1B2RXZ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnldc1B2RXZ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnldc1B2RXZ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pnldc1B2RXZ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pnldc1B2RXZ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnldc1B2RXZ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnldc1B2RXZ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnldc1B2RXZ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnldc1B2RXZ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms