Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms