Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scml2B1AVB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scml2B1AVB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scml2B1AVB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scml2B1AVB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scml2B1AVB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scml2B1AVB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scml2B1AVB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scml2B1AVB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scml2B1AVB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scml2B1AVB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scml2B1AVB3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms