Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprsB0V2N1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprsB0V2N1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprsB0V2N1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprsB0V2N1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprsB0V2N1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprsB0V2N1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprsB0V2N1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprsB0V2N1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprsB0V2N1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprsB0V2N1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprsB0V2N1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms