Protein–RNA interactions for Protein: A2A7V7

Cd300c, CMRF35-like molecule 6, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300cA2A7V7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd300cA2A7V7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd300cA2A7V7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd300cA2A7V7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd300cA2A7V7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd300cA2A7V7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd300cA2A7V7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd300cA2A7V7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300cA2A7V7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd300cA2A7V7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300cA2A7V7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300cA2A7V7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300cA2A7V7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300cA2A7V7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300cA2A7V7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300cA2A7V7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300cA2A7V7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300cA2A7V7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300cA2A7V7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms