Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf19bA2A7Q9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf19bA2A7Q9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf19bA2A7Q9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf19bA2A7Q9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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Rnf19bA2A7Q9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf19bA2A7Q9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf19bA2A7Q9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf19bA2A7Q9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf19bA2A7Q9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf19bA2A7Q9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf19bA2A7Q9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf19bA2A7Q9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf19bA2A7Q9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf19bA2A7Q9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf19bA2A7Q9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf19bA2A7Q9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf19bA2A7Q9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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Rnf19bA2A7Q9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
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Rnf19bA2A7Q9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnf19bA2A7Q9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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Rnf19bA2A7Q9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf19bA2A7Q9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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Rnf19bA2A7Q9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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Rnf19bA2A7Q9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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Rnf19bA2A7Q9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf19bA2A7Q9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf19bA2A7Q9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf19bA2A7Q9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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