Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn2aA0A0J9YTW6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn2aA0A0J9YTW6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn2aA0A0J9YTW6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn2aA0A0J9YTW6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn2aA0A0J9YTW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn2aA0A0J9YTW6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms