Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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