Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cited4Q9WUL8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms