Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa11P50709 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms