Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcrg-V1P06325 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms