Protein–RNA interactions for Protein: O35099

Map3k5, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k5O35099 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Map3k5O35099 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Map3k5O35099 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Map3k5O35099 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Map3k5O35099 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Map3k5O35099 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k5O35099 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Map3k5O35099 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k5O35099 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k5O35099 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms