Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms