Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20509G3UZF1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20509G3UZF1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20509G3UZF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20509G3UZF1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20509G3UZF1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20509G3UZF1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20509G3UZF1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20509G3UZF1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms