Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ino80eA0A0U1RP99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80eA0A0U1RP99 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms