Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited4Q9WUL8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited4Q9WUL8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms