Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3glb1Q9JK48 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms