Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx6Q9ER75 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx6Q9ER75 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms