Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr1Q9EPQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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