Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D3J9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D3J9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms