Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lrrn2Q6PHP6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn2Q6PHP6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms