Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mdh1bQ5F204 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdh1bQ5F204 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms