Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms