Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa11P50709 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms