Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5cP41230 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5cP41230 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5cP41230 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms