Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpraP18052 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpraP18052 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpraP18052 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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