Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv30A0A0B4J1P1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms