Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms