Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71LQ8N9Z2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71LQ8N9Z2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms