Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930004D18RikQ8C8W7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930004D18RikQ8C8W7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms