Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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