Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trappc8E9PWG2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc8E9PWG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms