Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80eA0A0U1RP99 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80eA0A0U1RP99 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms