Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc1Q5NCF2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms