Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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