Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk4Q8VEJ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms