Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fscn3Q9QXW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms