Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem260Q8BMD6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tmem260Q8BMD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tmem260Q8BMD6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem260Q8BMD6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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