Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctf1Q60753 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctf1Q60753 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms