Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubiad1Q9DC60 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms