Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730522E02RikQ5SP45 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms