Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lama1P19137 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lama1P19137 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lama1P19137 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lama1P19137 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms