Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcrg-V1P06325 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms