Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHLDB3Q6NSJ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDB3Q6NSJ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms