Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pik3c2aQ61194 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pik3c2aQ61194 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pik3c2aQ61194 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms