Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Lmod2Q3UHZ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lmod2Q3UHZ5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lmod2Q3UHZ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms