Protein–RNA interactions for Protein: P16381

D1Pas1, Putative ATP-dependent RNA helicase Pl10, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D1Pas1P16381 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
D1Pas1P16381 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D1Pas1P16381 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D1Pas1P16381 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms