Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry2Q9R194 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cry2Q9R194 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms